CREDO est structuré en trois (3) instances dont deux (2) instances d’orientation stratégiques et de décision (l’Assemblée Générale et le Conseil d’Administration) et une instance opérationnelle à savoir le Secrétariat Permanent (SP). Le Secrétariat Permanent qui rend compte directement au Conseil d’Administration, est dirigé par un Secrétaire Général appuyé d’une part, par deux Directions Techniques notamment la Direction des Programmes, des Etudes et de la Planification (DPEP) et la Direction Administrative et Financière (DAF) et d’autres part, par deux services de soutiens en l’occurrence les services Audit Interne et Communication. Au sein de la DPEP est rattaché un Service de Suivi-Evaluation & Apprentissage et six (06) programmes. La DAF quant à elle, se voit rattaché trois (03) principales services que sont le service Ressources Humaines, le service Comptabilité et Finances et le service Achat et Comptabilité Matière.
